عام 1970 م ، أي بعد حصوله على الماجستير عيِّن باحثاً في مجمع البحوث الإسلامية . سافر إلى فرنسا عضواً في بعثة الأزهر لدراسة الفلسفة الإسلامية بالسوربون جامعة باريس وحصل على دبلوم عال في الفلسفة الإسلامية 1971 - 1973 م . وفي عام 1974 م عيِّن مدرّساً للفلسفة بكلية أصول الدين في جامعة الأزهر ، وفي عام 1978 م عمل أستاذ الفلسفة الإسلامية المساعد ؛ معاراً لكلّية التربية . عام انتدب 1982 م قائماً بأعمال عميد لكلّية الدراسة الإسلامية والعربية للبنين بالقاهرة ، وبعد سنتين عيِّن أستاذ الفلسفة الإسلامية ، وعميداً لكلّية الدراسات الإسلامية والعربية للبنين بجامعة الأزهر . وفي عام 1993 م انتدب أميناً عاماً للمجلس الاعلى للشؤون الإسلامية ، وبعد عام واحد استقال من منصبه ، ثم ما لبث أن انتدب ثانيةً . انتخب عام 1998 م عضواً مشاركاً ببحث في مؤتمر الجمعية الفلسفية الأفرو أسيوية ، الجامعة العربية . وفي عام 2000 م اختير عضواً بمجمع البحوث الإسلامية ، وفي عام 2003 م اختير عضواً بمجمع اللغة العربية . شارك الأستاذ الدكتور الفيومي في عدّة مؤتمرات ، منها : - مؤتمر القدس ، حيث ألقى بحثاً بعنوان « مأساة وطن عربي إسلامي » عام 2003 م بلندن ، وبرعاية المركز الشيعي الإسلامي . - مؤتمر مجمع البحوث الإسلامية ، فألقى بحثاً بعنوان « الإسلام والحضارة » عام 2002 م بالقاهرة .